• 1. 中国人民解放军总医院临床药理学研究室(北京 100853);
  • 2. 山西中医药大学中药学院(山西晋中  030600);
  • 3. 首都医科大学宣武医院药学部(北京 100053);
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目的 通过对胃癌样本基因的富集分析,探索其中 RNA 可变剪接的变化情况及相关分子机制。方法 回顾性收集中国人民解放军总医院的 3 例胃癌患者的癌组织及其癌旁组织的病理样本,进行蛋白定量标记、基因芯片检测、高通量测序等以获取数据;通过 DAVID 等网络软件对样本做 GO 富集和 KEGG 通路分析,得出筛选出的基因的差异可变剪接相关信息。结果 总共筛查了与 ENSEMBL 数据库的基因标识一致的具有单独 ENSG ID 的基因 605 个,癌组织与癌旁组织基因水平的差异比较结果表明,其中无差异基因 411 个,差异上调基因 119 个,差异下调基因 75 个;从中筛出差异可变剪接基因共 69 个。GO 富集和 KEGG 通路分析发现,检测基因主要与分子代谢进程、细胞迁移、细胞外基质组织、血液凝固、细胞基质黏附、信号转导、细胞凋亡负性调控、血管再生、血小板激活、补体系统、脂肪因子信号通路、过氧化物酶体、癌症通路、转化生长因子(TGF)信号通路、轴突导向、细胞周期等有关。结论 与癌旁组织比较,胃癌组织样本中存在着大量差异可变剪接基因,由于剪接位点改变所导致的表达差异可能在胃癌的发生和发展中起着重要的作用。

引用本文: 王一晨, 王瑾, 杨文山, 刘屏, 董宪喆, 胡园. 胃癌基因芯片测序与异常基因差异表达. 中国普外基础与临床杂志, 2020, 27(7): 790-800. doi: 10.7507/1007-9424.201910023 复制

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