• 武汉市第一医院甲状腺乳腺外科(武汉  430022);
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目的 通过构建男性乳腺癌的竞争性内源 RNA(ceRNA)调控网络,探讨其发病机制。方法 从 TCGA 数据库(The Cancer Genome Atlas Database)中下载男性乳腺癌的长链非编码 RNA(lncRNA)、微小 RNA(miRNA)和 mRNA 的表达谱数据,通过 R 软件的 limma 数据包分析男性乳腺癌差异表达的 lncRNA、miRNA 和 mRNA;分析三者之间的靶向调控关系,构建 ceRNA 网络,并用 Cytoscape 软件可视化,并将差异表达基因进行 GO 富集和 KEGG 通路分析。结果 男性乳腺癌中差异表达的 lncRNA 为 275 种,差异表达的 miRNA 为 33 种,差异表达的 mRNA 为 1 675 种。本研究成功构建了男性乳腺癌的 lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA 网络后,GO 富集分析显示,差异表达 mRNA 参与细胞增殖的负调控、转录的负调控、细胞蛋白质代谢过程的调控、细胞迁移的调控、转移酶活性的正调控、间充质细胞增殖的正调控等。KEGG 通路分析显示,差异表达 mRNA 参与癌症的途径、白细胞跨内皮迁移、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)和神经营养蛋白信号通路。结论 本研究基于 TCGA 数据库成功构建了男性乳腺癌的 ceRNA 网络。

引用本文: 章锐, 祝孔俊, 杜秋丽, 袁媛, 阮剑, 赵建国. 利用 TCGA 数据库构建男性乳腺癌的lncRNA-miRNA-mRNA ceRNA 网络. 中国普外基础与临床杂志, 2021, 28(3): 380-384. doi: 10.7507/1007-9424.202005027 复制

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