• 郑州大学第一附属医院甲状腺外科(郑州  450052);
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目的 进一步了解甲状腺乳头状癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)发生发展的生物分子机制,寻找新的临床病理特征判断依据以及预后评价和靶向治疗的新分子靶点。方法 通过分析基因表达综合数据库(GEO)中相关样本的基因芯片数据,筛选出 PTC 与正常甲状腺组织细胞中的差异表达基因(the differentially expressed genes,DEGs)。运用 STRING 及 DAVID 在线数据库对 DEGs 进行蛋白互作 (the protein-protein interaction,PPI )网络分析、GO 功能和生物学途径富集通路分析以及 KEGG 代谢通路分析,并从中筛选出关键基因。结果 本研究共筛选出 339 个 DEGs 及 10 个关键基因,其中 FN1、CCND1、TIMP1、ICAM1、APOE、MET、RUNX2、KRT19 和 SERPINA1 在 PTC 中的表达上调,KIT 在 PTC 中的表达下调。在对假设检验做多重检验校正后,可得 APOE [错误发现率 (false discover rate,FDR)=0.047 5] 及 KIT(FDR=0.042 0)基因表达的改变对 PTC 患者的无复发生存期(recurrence-free-survival,RFS) 有一定的影响,具有统计学意义。结论 FN1、ICAM1、APOE、MET、KRT19、KIT 和 SERPINA1 基因相对高表达的改变可能与 PTC 的预后有关。但需要进一步的研究来具体阐明这些基因在 PTC 发生发展过程中的生物作用机制。

引用本文: 奥伟, 殷德涛. 运用生物信息学筛选甲状腺乳头状癌生物靶点. 中国普外基础与临床杂志, 2021, 28(3): 329-335. doi: 10.7507/1007-9424.202006044 复制

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